根據(jù)立法法第71條的規(guī)定，國務(wù)院部門規(guī)章的制定機關(guān)是國務(wù)院各部、委員會、中國人民銀行、審計署和具有行政管理職能的直屬機構(gòu)。這類制定機關(guān)可以分為國務(wù)院組成部門和直屬機構(gòu)兩大類。國務(wù)院部委和中國人民銀行、審計署是國務(wù)院組成部門。國務(wù)院直屬機構(gòu)是主管國務(wù)院某項專門業(yè)務(wù)的部門，如國家工商行政管理總局、海關(guān)總署、國家稅務(wù)總局、國家新聞出版總署、國家宗教事務(wù)局等。直屬機構(gòu)的數(shù)量和職能因各屆政府的機構(gòu)設(shè)置和法律的規(guī)定而有所不同。

　　制定部門規(guī)章的主體，還因為單行法律的授權(quán)規(guī)定而出現(xiàn)。例如，1998年12月公布的證券法第179條規(guī)定，國務(wù)院證券監(jiān)督管理機構(gòu)的職責之一，是依法制定有關(guān)證券市場監(jiān)督管理的規(guī)章。根據(jù)第九屆中央人民政府的管理職能配置和機構(gòu)設(shè)置，行使國務(wù)院證券監(jiān)督管理職權(quán)的機構(gòu)是國務(wù)院的直屬事業(yè)單位中國證券監(jiān)督管理委員會。因此，這里行使部門規(guī)章制定權(quán)的就是國務(wù)院的事業(yè)單位。

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